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| 標本名 | 科 | 最大長（ｃｍ） | 備考 | 写真番号 |
| ワシミミズク | フクロウ科 | 43 | 小動物を食べる鳥 | KYB0001 |
| フクロウ | フクロウ科 | 40 | 小動物を食べる鳥 | KYB0002 |
| イヌワシ | ワシタカ科 | 50 | 小動物を食べる鳥 | KYB0003 |
| コチョウゲンボウ | ワシタカ科 | 20 | 小動物を食べる鳥 | KYB0004 |
| サシバ | ワシタカ科 | 30 | 小動物を食べる鳥 | KYB0005 |
| アカエリカイツブリ | カイツブリ科 | 30 | 水辺の鳥 | KYB0006 |
| コサギ | サギ科 | 45 | 水辺の鳥 | KYB0007 |
| カツオドリ | カツオドリ科 | 35 | 水辺の鳥 | KYB0008 |
| アホウドリ | アホウドリ科 | 60 | 水辺の鳥 | KYB0009 |
| コウノトリ | コウノトリ科 | 100 | 水辺の鳥 | KYB0010 |
| クイナ（オス） | クイナ科 | 25 | 水辺の鳥 | KYB0011 |
| ノガン | ノガン科 | 65 | 水辺の鳥 | KYB0012 |
| スズガモ | ガンカモ科 | 30 | 水辺の鳥 | KYB0013 |
| オシドリ（オス） | ガンカモ科 | 40 | 水辺の鳥 | KYB0014a |
| オシドリ（メス） | ガンカモ科 | 40 | 水辺の鳥 | KYB0014b |
| ヒシクイ | ガンカモ科 | 60 | 水辺の鳥 | KYB0015 |
| ヤマドリ（オス） | キジ科 | 60 | 野山の鳥 | KYB0016 |
| キジ（オス） | キジ科 | 60 | 野山の鳥 | KYB0017a |
| キジ（メス） | キジ科 | 61 | 野山の鳥 | KYB0017b |
| モズ（オス） | モズ科 | 18 | 野山の鳥 | KYB0018 |
| スズメ | スズメ科 | 12 | 野山の鳥 | KYB0019 |
| ハシブトカラス | カラス科 | 22 | 野山の鳥 | KYB0020 |
| イカル | アトリ科 | 15 | 野山の鳥 | KYB0021 |
| ヒバリ | ヒバリ科 | 15 | 野山の鳥 | KYB0022 |
| セッカ | ウグイス科 | 12 | 野山の鳥 | KYB0023 |
| コマドリ | ツグミ科 | 25 | 野山の鳥 | KYB0024 |
| エナガ | シジュウガラ科 | 12 | 野山の鳥 | KYB0025 |
| ヤマガラ（オス） | シジュウガラ科 | 15 | 野山の鳥 | KYB0026 |
| ルリビタキ（メス） | ツグミ科 | 12 | 野山の鳥 | KYB0027 |
| アオジ（メス） | ホオジロ科 | 13 | 野山の鳥 | KYB0028 |
| ミソサザイ（オス） | ミソサザイ科 | 10 | 野山の鳥 | KYB0029 |
| アオゲラ（メス） | キツツキ科 | 20 | 野山の鳥 | KYB0030 |
| オオアカゲラ | キツツキ科 | 15 | 野山の鳥 | KYB0031 |
| アカハラ（メス） | ツグミ科 | 20 | 野山の鳥 | KYB0032 |
| カササギ | カラス科 | 35 | 野山の鳥 | KYB0033 |
| ライチョウ（夏） | エゾライチョウ科 | 20 | 野山の鳥 | KYB0034a |
| ライチョウ（冬） | エゾライチョウ科 | 20 | 野山の鳥 | KYB0034b |
| ウグイス | ウグイス科 | 12 | 野山の鳥 | KYB0035 |
| コフウチョウ | フウチョウ科 | 40 | 珍しい鳥 | KYB0036 |
| オジロワシ | ワシタカ科 | 110 | 小動物を食べる鳥 | KYB0037 |
| タンチョウ（骨） | ツル科 | 110 | 水辺の鳥 | KYB0038 |
| ガチョウ（骨） | カモ科 | 65 | 水辺の鳥 | KYB0039 |
| ニワトリ（骨） | キジ科 | 65 | 野山の鳥 | KYB0040 |
| メジロ | メジロ科 | 10 | 野山の鳥 | KYB0041 |
| オオルリ | ヒタキ科 | 12 | 野山の鳥 | KYB0042 |
| シロハラ | ツグミ科 | 20 | 野山の鳥 | KYB0043 |
| ヤマドリ（メス） | キジ科 | 50 | 野山の鳥 | KYB0045 |
